El-Aksa Üniversitesi, bireyleri bilgi ve becerilerle donatmayı, sürekli öğrenmeye açık ve teknolojiyi kullanabilen bireyler yetiştirmeyi amaçlayan bir Filistin hükümetine bağlı eğitim kurumudur. Arap ve İslam kültürel değerlerine ve sorumluluk, şeffaflık ve adalet gibi insan hakları ilkelerine bağlıdır.

7 Ekim 2023’ten bu yana İsrail işgali, Gazze Şeridi’ndeki üniversiteleri, El-Aksa Üniversitesi’nin Han Yunus şubesi de dahil olmak üzere hedef almakta ve yok etmektedir. Bu saldırılarda birçok üniversite rektörü, akademisyen ve aileleri hedef alınmış, üniversite binaları doğrudan bombalanarak tamamen yıkılmıştır.