كان يطلق عليه أسم مسجد الشيخ عجلين، حيث أنه يقع في منطقة الشيخ عجلين على شاطئ البحر غرب مدينة غزة، أعيد إعماره بتبرع من رضوان كامل حاكم ولاية جاوة الغربيّة – أندونيسيا، عبر مؤسسة أمان فلسطين، بعد تعرضه لتدمير كامل من قبل الاحتلال الإسرائيلي خلال العدوان الذي استهدف قطاع غزة عام 2014، وتم افتتاحه عام 2022.

فخرج بحُلَّته الجديدة على مساحة 1350م، وهو مسجد يتّسع لاستقبال نحو 2000 مُصَلٍّ، ويتكون من ثلاثة طوابق، يتضمن المركز مكتبة، ومصلّى للنساء، وعيّادة طبيّة، ودورات مياه، وغرفة للوضوء مُلْحَقة بالمسجد.

قام طيران الاحتلال الإسرائيلي في 4-2-2025، باستهداف مسجد خليل الوزير في حي الشيخ عجلين في جنوب غرب غزة، مما أدى إلى تدميره تدميراً كلياً.