مسجد السيدة رقية مسجد تاريخي أثري يقع في شرق مدينة غزة، يوجد في وسط شارع بغداد في حي الشجاعية الواقع في البلدة القديمة لغزة، وهو من أحد المساجد التي بنيت في عصر الدولة المملوكية ، ويقال أن اسمه ينسب إلى رقية بنت أحمد زوجة أحد حكام غزة القدام، تبلغ مساحة المسجد حوالي 174 مترًا مربعًا ويتكون من إيوان واحد كبير يشكل بيت الصلاة وبه محراب.

وخلال اقتحام جيش الاحتلال الإسرائيلي للشجاعية خلال حرب طوفان الأقصى، قام الاحتلال بتدمير المسجد تدميراً كلياً.